这名少女，乘着台风而来——教会我们“真正重要的事”的，与不可思议的少女的一夜物语。舞台为某座离岛，文化祭前日的中学。放弃了自幼开始一直坚持的棒球，以此为契机与好友西条吵架的东，与突然出现的不可思议的红瞳少女诺尔达相遇了。“当‘地之涡’和‘天之涡’和‘我’连为一体之时，这颗星球将迎来重生……”此时，观测史上最大级的台风向着学校袭来——