清末，宝芝林所在的广东地区出现饥荒，不料朝廷的赈灾银两却被一伙不知名的贼人所劫黄麒英和知府到现场查探，根据在案发现场得到的蝙蝠形状的飞镖，判断此案有可能是江洋大盗黑蝙蝠所为真正的黑蝙蝠（李淮南）知道自己被人嫁祸，也带着跟班梁宽来到广东，希望暗中调查，为自己洗脱冤屈。他一方面以医生的身份救济灾民，一方面以黑蝙蝠的身份，劫富济贫，暗夜来到各大商行和知府家中，逼迫他们捐出银两，来解除广东的灾情，商行和知府惶惶不可终日，只得捐出大量银两。其实，假冒黑蝙蝠，劫走赈灾款的幕后真凶是八王爷，他企图用劫来的银两购买武器，为其日后疯狂的计划做准备，谁知真正的黑蝙蝠以及朝廷神捕杨长风都来到了广东追查此事。神捕杨长风决定使出暗度陈仓的计策，假意让人押送银两，实则是为了引出黑蝙蝠。押送银两的队伍出发后，李淮南担心假黑蝙蝠再伺机抢劫，便带着梁宽也暗中跟随保护银两，并遇到了八爷手下的红玉一伙人。最终，黄飞鸿为李淮南洗清了冤屈，黄飞鸿也因此受到了朝廷表彰，杨长风则放走了李淮南，随便抓了一个劫银的贼人当作黑蝙蝠，回京复命。李淮南则准备远渡重洋学医，把梁宽托付给了黄飞鸿，继而黄飞鸿收了梁宽做徒弟。