金田正太郎与铁雄是自小便在孤儿院认识，从小到大的好朋友，而在一次飞车党追逐拚斗之中，以金田为首的飞车党在一次和另一飞车党（小丑党）的殴斗中，成员铁雄因为与小丑党其中一名成员战斗，而撞上一个从政府研究所跑出的实验体（超能力者）铁雄因遇到这个具有超能力的小孩（高志）而发生车祸受重伤，不久政府军方前来带走了高志，同时铁雄亦被军方给带走。等到金田一行人前去搭救时，重伤的铁雄已经被军队带回研究所，金田亲眼目睹铁雄及超能力小孩都被军方给带走了。因为这次意外事故，铁雄开启了自身的超常神秘力量，获得了惊人的能力，堪与阿基拉匹敌。因此他成为了军队的新研究对象。短短几天，铁雄就获得了惊人的能力，连现代武器也对付不了他。慢慢他发现自己拥有凌驾于一切之上的能力，自己的意志力强大的足以和军队抗衡，於是他开始疯狂的按照自己的意志来做自己想做的事情，他一心想找到所有秘密的关键所在——阿基拉。想找出阿基拉向他挑战。一直不满于被金田等人保护的铁雄会干出什么？新东京的命运又会怎样呢？31年前的毁灭，是因为阿基拉，31年後新东京会否因为铁雄而毁灭呢？